要弄清楚生物安全柜和超凈工作臺的區(qū)別首先要弄清楚他們的原理，生物安全柜是一種負壓的凈化工作臺，工作時會往里面吸氣，其目的是為了避免有害物質污染實驗室，保護實驗員、受試樣品。

但是，潔凈工作臺是正壓工作臺，工作時會把空氣吸入過濾器中，空氣經過過濾后吹出，這樣可以保護樣品，卻并不能保護實驗員。從潔凈度角度分析，生物安全柜的潔凈度要比超凈臺高，但潔凈工作臺操作相對簡單。

生物安全柜的操作就有很多需要注意的地方，比如，使用之前，一定要做好個人防護，戴上手套、穿好防護服或者隔離衣，必要時還需要佩戴護目鏡。生物安全柜內部也要避免使用酒精燈。柜內擺放的物品要盡量呈橫向一字擺開，避免造成交叉感染，同時避免擋住背部回風隔柵影響正常風路。 操作時緩慢移動，以免影響正常風路狀態(tài)。 柜內盡量避免震動，如果柜內有兩種及兩種以上物品需要移動時，應遵循低污染性物品向高污染性物品移動的原則。